自动解剖模板是一个包含人脑图谱的软件包，这个软件包在脑功能成像的研究中十分常用，人们可以借助自动解剖模板软件包，获取具有特定功能的脑区的解剖学位置。换句话说，自动解剖模板将脑图谱中脑区的划分对应到脑功能数据上。
自动解剖模板软件包由法国卡昂的一个研究小组开发，需要依赖Matlab和SPM运行。
自动解剖模板的解剖学数据来自于蒙特利尔神经医学部（MNI）提供的空间归一化的单个被试高分辨率T1解剖分割。在分割的过程中，MNI的被试大脑的主沟先被标记出来，作为两个半球各45个解剖学脑区的定义标准。这个过程使用了一个专门的软件，该软件允许对编辑过的大脑进行三维追踪。随后，每隔2毫米在高分辨率的被试大脑轴向切片上进行脑区手动绘制。最后，对90个脑区进行重建，并打上标签。
基于MNI脑区分割方法，自动解剖模板采用了三种方法来进行脑功能研究中的自动解剖学标记：
第一，标记根据坐标定义的脑区边界。
第二，标记与某个坐标为球心的球的内部的体素中，属于每一个解剖学脑区的体素的百分比。
第三，标记激活的脑区中，属于每一个解剖学脑区的体素的百分比。
参考文献
[1] Tzourio-Mazoyer N, Landeau B, Papathanassiou D, et al. Automated anatomical labeling of activations in SPM using a macroscopic anatomical parcellation of the MNI MRI single-subject brain[J]. Neuroimage, 2002, 15(1): 273-289.
[2] https://en.wikipedia.org/wiki/Automated_Anatomical_Labeling
