Behavior Atlas三维动物行为智能分析系统

 

产品介绍

1.产品功能

         Behavior Atlas三维动物行为智能分析系统(下称“Behavior Atlas”)是计算机科学应用在实验动物领域的跨时代高新技术产品,致力于为科研人员、药物开发研究人员、动物实验人员提供更智能、更高效、更便捷的动物实验及数据分析系统。

         Behavior Atlas系统将计算机视觉和深度学习技术结合,从多个视角对动物行为进行拍摄并追踪动物身体的关键点,重建为三维运动骨架序列,从中利用基于深度学习的算法检测动物的行为序列(例如:行走、跑、转向、站立、抓挠等)。

2.产品优势

         Behavior Atlas系统优势在于:

  • 系统能自动识别分析近50种动物行为。其中包括使用传统方法极难发现的grooming、hunching等行为。对时间片段较短的动物行为算法也能较好的识别(最短识别出平均时长1.7s的行为),大量丰富行为图谱;
  • 充分考虑到动物实验过程中的实际操作问题,可兼容啮齿类动物的多种行为箱,并能同步进行电生理、光学成像以及光遗传等实验;
  • 系统整体提供一站式便捷服务,所有系统调整(包括3D定标、关键部位提取、数据分析)都可以一键完成。基于深度学习的行为分析算法部署在云平台,自动进行持续学习和更新。

3.工作流程

         Behavior Atlas系统由数据采集系统、3D建模工作站、数据学习分析平台三部分组成。工作流程如下:

         用户可根据自身情况,选择采购使用3D建模工作站统,对视频数据进行3D建模预处理,再上传分析(适用于实验频次多、数据量较大的情况);也可直接把原始视频数据上传到云平台进行分析(单次传输和运算成本较高,适用于实验频次低、数据量较少的情况)。

4.产品参数

4.1 数据采集系统

  • 内部空间尺寸为850×850×700mm,采用4摄像头按图像分辨率720p同步采集,每秒30帧,帧间误差延时不超过±10%。
  • 采集空间3D定标由用户操作一键完成。
  • 硬盘可保留160T数据。
  • 实验视频录制完成后,可使用移动硬盘、局域网等方法导出到3D建模工作站,也可直接上传到数据学习分析平台(云平台)进行分析。

4.2 3D建模工作站

  • 配备适用于3D计算的高算力工作站。预部署Behavior Atlas视频编辑与3D建模软件。
  • 可接受移动硬盘、局域网等方法传输的实验视频数据,一键完成建模,形成3D数据序列。
  • 用户手动上传3D数据序列上数据学习分析平台进行分析,在线获取分析报告。

3D模型构建示意图

4.3 数据学习分析平台

  • 部署动物行为算法,接受用户上传数据,在线提供分析报告并提供下载,简单易用。
  • 算法基于机器学习,持续自我优化。
  • 云平台还提供即时通讯、文件系统、团队管理、项目管理、数据加密等功能,方便用户以项目组形式进行协作。

从高维连续行为特征到行为表型鉴定示意图

应用案例

         中科院深圳先进技术研究院黄康、蔚鹏飞博士等技术团队论文《Mapping Mouse Behavior with an Unsupervised Spatio-temporal Sequence Decomposition Framework》预印版已经发表在BioRxivhttps://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.09.14.295808v2.full

         论文使用本分析系统对Shank3突变型小鼠异常行为进行了鉴定,采集了Shank3-/-KO)和WT6只小鼠的旷场行为,共12组数据,每组15分钟。

         统计12只小鼠的行为活动占比:发现这两组小鼠有两类行为存在显著差异;结合事后观察,这两类行为为self-groominghunchingKO小鼠的这两类行为相比WT出现更为频繁。

         Shank3突变小鼠的Self-grooming增多是以前广为报道的,但Hunching行为的增加很少有研究提到。可能原因在于Self-grooming单次出现持续时间长(7.13±7.81 s)Hunching更短(1.47±0.31s),所以在无论是人为观察,还是自动分析算法都容易忽视掉此差异。

         使用本分析系统所得结论,是首次在Shank3突变小鼠上观察到的新的行为Marker

 

描述 文件 单价 购物车
Behavior Atlas三维动物行为智能分析系统
关闭

专业人员会在24小时之内联系您

Behavior Atlas三维动物行为智能分析系统
{{item}}
关闭 提交
Copyright © 2019-2022 南京超维景生物科技有限公司 版权所有 www.ipanqiao.com苏ICP备20009590号-1
联系我们
立即做合同
微信客服
电话咨询

400-998-9826

17302548620

泮桥成像光电商城专业人员会在24小时之内联系您

关闭 提交