产品介绍
1.产品功能
Behavior Atlas三维动物行为智能分析系统(下称“Behavior Atlas”)是计算机科学应用在实验动物领域的跨时代高新技术产品,致力于为科研人员、药物开发研究人员、动物实验人员提供更智能、更高效、更便捷的动物实验及数据分析系统。
Behavior Atlas系统将计算机视觉和深度学习技术结合,从多个视角对动物行为进行拍摄并追踪动物身体的关键点,重建为三维运动骨架序列,从中利用基于深度学习的算法检测动物的行为序列(例如:行走、跑、转向、站立、抓挠等)。
2.产品优势
Behavior Atlas系统优势在于:
3.工作流程
Behavior Atlas系统由数据采集系统、3D建模工作站、数据学习分析平台三部分组成。工作流程如下:
用户可根据自身情况,选择采购使用3D建模工作站统,对视频数据进行3D建模预处理,再上传分析(适用于实验频次多、数据量较大的情况);也可直接把原始视频数据上传到云平台进行分析(单次传输和运算成本较高,适用于实验频次低、数据量较少的情况)。
4.产品参数
4.1 数据采集系统
4.2 3D建模工作站
3D模型构建示意图
4.3 数据学习分析平台
从高维连续行为特征到行为表型鉴定示意图
应用案例
中科院深圳先进技术研究院黄康、蔚鹏飞博士等技术团队论文《Mapping Mouse Behavior with an Unsupervised Spatio-temporal Sequence Decomposition Framework》预印版已经发表在BioRxiv:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.09.14.295808v2.full
论文使用本分析系统对Shank3突变型小鼠异常行为进行了鉴定,采集了Shank3-/-(KO)和WT各6只小鼠的旷场行为,共12组数据,每组15分钟。
统计12只小鼠的行为活动占比:发现这两组小鼠有两类行为存在显著差异;结合事后观察,这两类行为为self-grooming和hunching。KO小鼠的这两类行为相比WT出现更为频繁。
Shank3突变小鼠的Self-grooming增多是以前广为报道的,但Hunching行为的增加很少有研究提到。可能原因在于Self-grooming单次出现持续时间长(7.13±7.81 s),Hunching更短(1.47±0.31s),所以在无论是人为观察,还是自动分析算法都容易忽视掉此差异。
使用本分析系统所得结论,是首次在Shank3突变小鼠上观察到的新的行为Marker。
描述 | 文件 | 单价 | 购物车 | |
Behavior Atlas三维动物行为智能分析系统 |
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