⾮⼈灵⻓类三维⾏为采集分析系统

 

产品说明

         ⼀湾⽣命科技⾃主研发的三维⾏为采集设备,是国内⾸家⽆标记(Markerless)三维动物姿态捕捉设备。⽆需在动物⾝上添加任何物理标记,就能精准地识别动物⾝体的多个(16个点以上)部位,追踪三维⻣骼序列。

 

 

 

 

 

16点追踪三维⻣架
 
BehaviorAtlas三维精细⾏为分析系统包含三个部分
 
  • 三维⾏为采集设备:录制视频
  • BA-Analyzer:数据处理软件
  • BA-Explorer:数据分析软件

 

产品特⾊

  • 多视⻆拍摄,有效解决动物⾝体遮挡,避免视野盲区
  • 多相机可灵活调整视⻆,并能实现快速对相机进⾏标定
  • 提取动物多个⾝体部位,并且可以实现⾃定义的精准追踪
  • 对攀爬等垂直⽅向的运动可以灵敏的检测 采集精度达毫⽶级

 

BehaviorAtlas采集设备 → BA-Analyzer软件的⼯作流程
⼏种常⻅的动作类型
 

⾮⼈灵⻓类、⼤⿏、⽝类三维⾏为采集分析系统配置单

类型
产品名称
型号
选购情况
硬件
⾮⼈灵⻓类/⼤⿏/⽝类三维采集设备
BA-DC01 monkey/rat/dog
必选
硬件
⾼性能⾏为采集分析⼯作站
BA-HP workstation
可选
软件
视频采集软件
BA-Capture monkey/rat/dog
必选
软件
本地数据处理软件
BA-Analyzer Local monkey/rat/dog
必选
软件
数据分析可交互软件
BA-Explorer monkey/rat/dog
可选

 

 

使⽤BA-Analyzer软件进⾏数据处理

         BehaviorAtlas Analyzer (BA - Analyzer ) 是基于⼈⼯智能 ( ArtifificialIntelligence ,AI )及计算机视觉技术研发的⼀款针对实验动物⾏为学数据处理软件。旨在通过对动物多个⾝体点精准追踪,以及⾃动化识别动物⾏为模块,实现⾼精准、⾼效化的动物⾏为评估。

 

软件特⾊
  • 多视⻆3D⻣架重建
  • 运动学参数提取,基于上述3D⻣架、⾏为序列,计算动物速度、运动强度、体型参数、位置参数
  • ⾏为序列提取核⼼引擎基于动物⾏为类语⾔结构的算法模型
  • 可以精准提取超过30种⾏为亚型*,包括⾏⾛、奔跑、战⼒、抓挠、嗅探等

 

⾼性能⼯作站推荐配置
  • 操作系统:Windows10
  • 64-bit CPU:Intel i9-12900k
  • 显卡:Nvidia GeForce RTX3090Ti
  • 内存:DDR5 64GB RAM
  • 硬盘:2TB固态硬盘

 

使⽤BA-Explorer软件进⾏可视化 预览和数据导出

         BehaviorAtlas Explorer (BA-Explorer) 是⼀款⽤于精细化动物⾏为数据交互 式预览、可视化预览、数据分析、数据导出和图像导出的集成化软件。我们致⼒于提升您在数据处理、绘图时的体验。BA -Explo re r可以设置多个⼦窗⼝,您可以同步预览某⼀动作的实时视频、⻣架重建、轨迹谱、⾏为谱等图像,并通过分组功能,对⽐分析多个组别的样本,完成⾏为特征的分类(Clustering)和⾏为图谱(Atlas)的⽣成。BA -Explorer⽀持您进⾏多种参数计算、数据导出以及 图像绘制等功能。
 
软件特⾊
  • 交互式、可视化数据预览
  • 多组别样本对⽐分析
  • 全⾯且强⼤的数据分析⼯具箱
  • 绘制及导出10多种⽤于发表和汇报的图像
  • 针对不同疾病模型和范式的专业版功能

 

BA-Explorer功能
 
1.提供可视化数据预览
包括原始视频预览(Video View)、⻣架重建预览(Skeleton View)、轨迹谱预览(Trajectory View)、⾏为谱(Ethogram)、运动特征演变(Movement Feature Evolution)、 运动相似度热图(Movement Similarity Heatmap)、轨迹速率热图(Trajectory-velocity Heatmap)、位置热图(Position Heatmap)、步态检测(Gait Detection)、运动平均⻣架 (Movement Average Skeleton)等。
 
2.提供实验组(Test)与对照组(Control)的对⽐分析
 
3.提供全⾯且强⼤的⼯具箱
包括动作注解(Movement Annotation)、事件相关运动(Event Related Movements)、步态参数计算(Calculate Gait Parameters)、运动学参数计算(Calculate Kinematical  Parameters)、动作占⽐计算(Calculate Movement Fraction)、两点距离计算(Calculate Distance Between 2 Body Parts)、三点⻆度计算(Calculate Angle Between 3 Body Parts)等
 

⾏为成分的时空特征空间。3D散点图上的每个点代表⼀个动作⽚段(n = 935段)。

11种不同的颜⾊对应11种运动类型。

成对相似性矩阵图,底部⽤树状图进⾏重新排列。

矩阵上的每个像素代表第i⾏第j列的⼀对运动⽚段的归⼀化相似度值。

位置热图

速度热图

实验组(KO,⾃闭症模型)和对照组(WT)⼩⿏之间动作类型分数的⽐较。

底部颜⾊标签和树状图 表⽰动作类型,可以发现KO⼩⿏在⼸背(Hunching)和理⽑(Self-grooming)等动作上表现出了更多的倾向性。

实验组和对照组动物的低维表⽰。在同⼀动作类型下,两组动物具有明显的区分。

 

实验组(KO,⾃闭症模型,下半部分)和对照组(WT,上半部分)8种典型动作的⾏为谱。可以发现,KO⼩⿏在⼸背(Hunching)和理⽑(Self-grooming)等状态下停留了更多的时间。

运动学参数对比

运动占比对比

 

1.多种类模式动物:
已对⼩⿏、⼤⿏、猴⼦、⽝等动物进⾏硬件、软件适配。更多种类的模式动物⾏为分析系统正在开发中。


2.多种动物⾏为学范式:
可以应⽤于旷场、新物体识别、三箱社交、社会等级、家居⾏为、本能恐惧等动物⾏为学范式,分析动物在某种认知或疾病下的特殊语⾔,助⼒神经类新药的研发以及临床前的应⽤。

 

⾮⼈灵⻓类三维⻣架重建

⽝类三维⻣架重建

⼤⿏三维⻣架重建

名称 型号 文件 单价 购物车
⾮⼈灵⻓类三维⾏为采集分析系统 BA-3D Monkey 01
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⾮⼈灵⻓类三维⾏为采集分析系统
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